Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nrif1Q923B3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms