Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atl3Q91YH5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atl3Q91YH5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms