Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Smg8Q8VE18 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smg8Q8VE18 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Smg8Q8VE18 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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