Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCL2

Sco2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco2Q8VCL2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sco2Q8VCL2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sco2Q8VCL2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms