Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ubxn4Q8VCH8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms