Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9Q8VC31 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms