Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
BbxQ8VBW5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BbxQ8VBW5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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