Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ApobrQ8VBT6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ApobrQ8VBT6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms