Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf183Q8QZS5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms