Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pitrm1Q8K411 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms