Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cdkl1Q8CEQ0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms