Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp27Q8CEG8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp27Q8CEG8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Usp27Q8CEG8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp27Q8CEG8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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