Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc73Q8CDM4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc73Q8CDM4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms