Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Phf20l1Q8CCJ9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms