Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E4f1Q8CCE9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms