Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Atg4aQ8C9S8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atg4aQ8C9S8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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