Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pm20d1Q8C165 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms