Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Atg16l1Q8C0J2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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