Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms