Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Smarcal1Q8BJL0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smarcal1Q8BJL0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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