Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ttc28Q80XJ3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ttc28Q80XJ3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ttc28Q80XJ3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ttc28Q80XJ3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Ttc28Q80XJ3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Ttc28Q80XJ3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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