Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ClmQ7TSN2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms