Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LnpkQ7TQ95 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LnpkQ7TQ95 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms