Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cnih3Q6ZWS4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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