Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc88cQ6VGS5 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc88cQ6VGS5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc88cQ6VGS5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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