Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx13Q6PHS6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms