Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Jmjd1cQ69ZK6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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