Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg9aQ68FE2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg9aQ68FE2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms