Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms