Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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Ptpn13Q64512 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ptpn13Q64512 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms