Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Zfp248Q640N4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms