Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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Ccdc18Q640L5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc18Q640L5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms