Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctr9Q62018 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms