Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PcolceQ61398 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcolceQ61398 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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