Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BcanQ61361 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BcanQ61361 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BcanQ61361 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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