Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nell2Q61220 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms