Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ncor1Q60974 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms