Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mkrn3Q60764 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms