Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Foxd4Q60688 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms