Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprnQ60673 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprnQ60673 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprnQ60673 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprnQ60673 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprnQ60673 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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