Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Bbs12Q5SUD9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms