Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH7

Zzef1, Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzef1Q5SSH7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zzef1Q5SSH7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms