Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ulk4Q3V129 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ulk4Q3V129 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms