Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Znf48Q3US17 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms