Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
E130208F15RikQ3UPV3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms