Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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