Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Edc4Q3UJB9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Edc4Q3UJB9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms