Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rnf149Q3U2C5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms