Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Psd3Q2PFD7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psd3Q2PFD7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms