Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmprss11cQ1JRP2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmprss11cQ1JRP2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms